据不完全统计，至7月3日，此次洪灾造成湖南全省养殖业直接经济损失接近20亿元。畜牧业受灾规模养殖场超过1万家，因灾死亡生猪7.4万头、大牲畜4110头、羊24035头、家禽78.72万羽，倒塌损坏栏舍54.6万平方米；受灾养殖水面面积105万亩，6282口网箱被冲毁，渔产品产量受损8.4万吨。

灾情发生后，湖南省畜牧水产部门奋起救灾补损。省畜牧水产局组织省水科所、天心种业等单位和龙头企业，搞好灾后种畜禽、水产种苗的生产和调运，做好填栏、塘库补养的准备。天心种业旗下10个种猪场，储备5万头优质种猪，按低于市场价20%的优惠价格，帮助受灾的规模养猪户恢复生产。省水科所联系3个水产种苗生产企业，储备1000万尾鱼苗，以鲢鱼、鳙鱼、鲤鱼、鲫鱼为主，待水退后立即调运灾区，支持受灾的养殖户补放鱼苗。

为了减轻洪灾造成的损失，湖南省畜牧水产局紧急调拨消毒物资63吨，组织对受灾养殖场开展消毒灭源工作；紧急调拨动物疫苗800万头份，组织对灾区规模养殖场进行免疫抗体监测，对尚未免疫或抗体不达标的畜禽进行补免和紧急免疫，严防动物疫病的发生和流行。